Меню

8 800 200-75-15
+7 495 640-17-71
mail@dna-technology.ru

Поиск

АнеуПГТ

Набор реагентов для выявления хромосомных аномалий в единичных клетках методом высокопроизводительного секвенирования NGS на платформе Illumina

Внешний вид товара может отличаться от изображенного на фотографии.

Набор регентов АнеуПГТ предназначен для проведения преимплантационного генетического тестирования на анеуплоидии (ПГТ-А).

АнеуПГТ позволяет детектировать:
- изменение копий числа всех хромосом, включая половые;
- частичные дупликации и делеции (>10 Мб в автоматическом режиме);
- мозаичные изменения.

Принцип метода: полногеномное высокопроизводительное секвенирование с низким покрытием (shallow sequencing) в единичных клетках трофэктодермы.

Преимплантационное генетическое тестирование (ПГТ) проводится для эмбриона в ходе экстракорпорального оплодотворения (ЭКО) до его переноса в полость матки. ПГТ-А (тестирование на анеуплоидии) направлено на поиск изменений числа копий хромосом эмбриона (CNV). Обычно в качестве биоматериала исследуются единичные клетки трофэктодермы, получаемые в ходе биопсии эмбриона на 5-6 день его развития. Биопсия проводится эмбриологом в клинике ЭКО, затем образцы отправляются в лабораторию для исследования. По результатам ПГТ-А принимается решение о переносе эмбриона в полость матки.

Преимущества набора АнеуПГТ
- Набор имеет РУ.
- Адаптирован под секвенаторы NextSeq550/550Dx и MiSeq от Illumina, Геноскан 4000 от Сесана. Секвенаторы MiSeq и Геноскан 4000 пока не включены в РУ на набор реагентов.
- Решение под ключ — поставляем реагенты для полногеномной амплификации (WGA) и подготовки библиотек, комплект реагентов для секвенирования* и ПО для анализа результатов.
- Автоматическое заключение по генотипу.
- Программное обеспечение входит в реестр российского ПО.
- Доступна автоматизированная очистка библиотек.
- Возможность смешанных запусков с НИПТ.
- Обучение новых клиентов всем этапам работы
- Автоматическое формирование в ПО расчетных таблиц для смешивания реагентов и SampleSheet.

Внимание! Для работы необходимо комплексное решение -  набор реагентов АнеуПГТ, комплект реагентов для секвенирования и программное обеспечение СекВарио АнеуПГТ.

Диагностические характеристики набора АнеуПГТ

  • Порог детекции сегментарных делеций и дупликаций
  • - >10 Мб при автоматическом генотипировании
  • - В ручном режиме возможна детекция CNV меньшего размера
Разрешение по мозаицизму от 20% анеуплоидных клеток
Ограничения метода Полиплоидия
Номенклатура генотипа в ПО: SCN 2020

 

Состав набора

  Комплектация
A.N.384 В.N.384 В.N.96х4

Реагенты для полногеномной амплификации (WGA)

+

+

+

Реагенты для подготовки и очистки библиотек (индексы в составе)

+

+

+

Комплект реагентов для секвенирования

-

1 шт NextSeq500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles)

4 шт. NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles) - 4 запуска по 96 образцов

 

Технические характеристики

Биоматериал Биоптаты трофоэктодермы
Метод полногеномной амплификации (WGA) Модифицированная MDA
Количество образцов (набор для WGA и подготовки библиотек) 384 образца
Количество образцов в запуске секвенаторов Зависит от используемой модели секвенатора, см.ниже
Время подготовки библиотек ручная методика - от 8 часов
с автоматизированной отмывкой на МЧ – от 6 часов
Условия хранения плюсовая часть +2...+8° С
минусовая часть -18…-22° С
Срок годности набора для WGA и подготовки библиотек 12 месяцев
Программное обеспечение СекВарио АнеуПГТ
Организация помещений Этап WGA проводится в отдельной комнате чистой зоны в ламинаре II класса защиты
Автоматизация Доступна автоматизированная очистка библиотек на МЧ:
  • - AutoPure-96 (Allsheng)
  • - или AutoPure-96 +ДТстрим (ДНК-Технология)
Специфическое оборудование:
  • - секвенатор на платформе, совместимой с Illumina
  • - IT-решение для установки ПО (сервер или облако)
  • - холодовой штатив
  • - амплификатор классический с горячей крышкой
  • - флуориметр
  • - оборудование для горизонтального гель-электрофореза

 

Типы детекции:

Валидированные секвенаторы*

Комплект реагентов для секвенирования

Количество образцов в запуске

Подходащая комплектация АнеуПГТ

NextSeq550/550Dx (Illumina)

NextSeq500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles) – 1 шт

384

В.N.384

NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles) – 4 шт

4 запуска по 96 образцов

В.N.96х4

MiSeq (Illumina)

MiSeq Reagent Kit v2 300 cycles (или 600 cycles)

(не входит в набор)

24

A.N.384

Геноскан 4000 (Сесана)

FCH PE75
(не входит в набор)

384

A.N.384

FCM PE75
(не входит в набор)

192

A.N.384

* Использование других моделей секвенаторов на платформах, совместимых с Illumina (например, NextSeq 1000/2000), возможно после проведения валидации

Программное обеспечение

Примеры результатов АнеуПГТ

Эуплоидный эмбрион, пол мужской — рекомендован к переносу
Анеуплоидный эмбрион, трисомия 20, пол женский — не рекомендован к переносу
Хаотичный эмбрион (1) — не рекомендован к переносу
Хаотичный эмбрион (2)— не рекомендован к переносу
Отображение списка результатов по образцам в ПО СекВарио АнеуПГТ