АнеуСкрин ИЛМ
Набор реагентов АнеуСкрин ИЛМ предназначе для неинвазивного скрининга беременных женщин на хромосомные аномалии плода (по крови матери).
Позволяет детектировать:
- анеуплоидии по аутосомам 13, 18, 21, половым хромосомам Х и Y;
- частичные дупликации и делеции(>10 Mb) по этим хромосомам;
- анеуплоидии по всем остальным хромосомам (RUO).
Принцип метода.
Полногеномное секвенирование с низким покрытием (NGS). Исследуется внеклеточная ДНК плода (плаценты).
Исследование проводится с 10 акушерской недели беременности.
Преимущества набора реагентов АнеуСкрин ИЛМ
- Набор имеет РУ.
- Позволяет работать с двуплодными беременностями (без оценки риска по половых хромосомам).
- Позволяет проводить исследование при донорской яйцеклетке и суррогатном материнстве.
- Автоматическое заключение о риске анеуплоидий.
- Адаптирован под секвенаторы NextSeq550/550Dx от Illumina, Геноскан 4000** от Сесана. Секвенатор Геноскан 4000 пока не включены в РУ на набор реагентов.
- Решение под ключ — поставляем реагенты для подготовки библиотек, комплект реагентов для секвенирования и ПО для анализа результатов.
- Программное обеспечение входит в реестр российского ПО.
- Доступно автоматизированное выделение вкДНК.
- Возможность смешанных запусков с ПГТ-А.
- Автоматическое формирование в ПО расчетных таблиц для смешивания реагентов и SampleSheet.
- Обучение новых клиентов всем этапам работы.
Внимание! Для работы необходимо комплексное решение - набор реагентов АнеуСкрин ИЛМ, комплект реагентов для секвенирования и программное обеспечение СекВарио АнеуСкрин.
Функциональное назначение: скрининг беременных женщин.
Показания к проведению исследования: оценка риска наличия анеуплоидий и хромосомных аномалий у плода.
Диагностические характеристики
| Целевые мишени |
|
| Дополнительные мишени (RUO) | Все остальные хромосомык |
| Возможность детекции мозаицизма | Да |
| Срок беременности, с которого возможно тестирование | С 10 акушерской недели |
| Ограничения метода |
|
Состав набора
| Комплектация | ||
| A (А.1 – А.8) | B (B.1 – B.8) | |
|
Реагенты для подготовки и очистки библиотек (индексы в составе) |
+ |
+ |
|
Комплект реагентов для секвенирования |
- |
1 шт NextSeq500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles) |
Внимание! Фасовки внутри одной комплектации (А.1 – А.8, B.1 – B.8) отличаются сетом индексов, входящих в их состав.
Технические характеристики
| Целевая группа | Все беременные женщины (в т.ч. если комбинированный скрининг анеуплоидии плода показан неопределенный риск) |
| Биоматериал | Периферическая кровь беременных женщин |
| Количество образцов | 48 |
| Время подготовки библиотек | от 8 часов (без учета пробоподготовки и проведения секвенирования) |
| Набор для выделения вкДНК | VAHTS Serum/Plasma Circulating DNA Kit (RUO) — не входит в состав набора |
| Валидированные пробирки для крови |
Пробирки со стабилизатором вкДНК: - StreckCell-Free DNA BCT (США) - GRANDBIOMED GBM scf-DNA (Грандбиомед, Россия) Либо пробирки с ЭДТА в конечной конц-и 2,0 мг/мл (транспортировка и хранение крови до получения плазмы на 2-8 °С не более 3 ч) |
| Срок годности набора для подготовки библиотек | 12 месяцев |
| Условия хранения |
плюсовая часть +2...+8° С минусовая часть -18…-22° С |
| Программное обеспечение | СекВарио АнеуСкрин |
| Автоматизация |
Доступно автоматизированное выделение внеклеточной ДНК: - AutoPure-96 (Allsheng) - AutoPure-96 +ДТстрим (ДНК-Технология) |
| Специфическое оборудование: |
- секвенатор на платформе, совместимой с Illumina - IT-решение для установки ПО (сервер или облако) - амплификатор классический с горячей крышкой - термошейкер с адаптером для пробирок 2,0 мл или термостат планшетного типа флуориметр |
|
Валидированные секвенаторы* |
Комплект реагентов для секвенирования |
Количество образцов в запуске |
Подходащая комплектация АнеуСкрин |
|
|
NextSeq550/550Dx (Illumina) |
NextSeq500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles) |
48 |
B (B.1 – B.8) |
|
|
Геноскан 4000 (Сесана) |
FCH PE75 (не входит в набор) |
48 | A (А.1 – А.8) | |
* Использование других моделей секвенаторов на платформах, совместимых с Illumina (например, NextSeq 1000/2000), возможно после проведения валидации
