HLA-Эксперт
Набор реагентов HLA-Эксперт предназначен для типирования генов HLA I (HLA-A, HLA-B, HLA-C) и HLA II (DRB1, DQB1, DPB1, DRB3/4/5) на уровне высокого разрешения в биологическом материале человека. Дополнительно возможно генотипирование DQA1.
Принцип метода
Таргетное высокопроизводительное секвенирование (NGS) на платформе Illumina.
Преимущества набора HLA-Эксперт
- Набор имеет РУ.
- Решение под ключ — поставляем реагенты для подготовки библиотек, комплект реагентов для секвенирования (часть комплектаций, см.в таблице с характеристиками набора), ПО для анализа результатов и таблицы сопровождения образцов.
- Автоматическое заключение о генотипе, контроль качества и траблшутинг в ПО.
- Регулярное обновление базы данных IPD-IMGT/HLA, встроенной в ПО.
- Набор адаптирован под секвенатор MiSeq от Illumina.
- Автоматический расчет объемов реагентов и формирование SampleSheet в таблице сопровождения образцов.
- Обучение новых клиентов всем этапам работы.
Диагностические характеристики набора HLA-Эксперт
| Целевые мишени |
• Экзоны 2, 3 и 4 для генов HLA I класса • Экзоны 2 и 3 для генов HLA II класса |
| Предел обнаружения | 5,0 нг ДНК человека на амплификационную пробирку, что соответствует концентрации ДНК 1,0 нг/мкл |
Состав набора
| Комплектация | |||
| v1 | v2-500 | v3-600 | |
|
Реагенты для подготовки и очистки библиотек (индексы в составе) |
+ |
+ |
+ |
|
Комплект реагентов для секвенирования |
- |
1 шт MiSeq Reagent Kit v2-500 cycles |
1 шт MiSeq Reagent Kit v3-600 cycles |
Технические характеристики
| Целевая группа |
• потенциальные доноров гемопоэтических стволовых клеток для включения в Регистр • потенциальные доноры и реципиенты с целью подбора гистосовместимого донора при трансплантации органов и тканей • супружеские пары с репродуктивными нарушениями • больные с иммуноопосредованными заболеваниями |
| Биоматериал | Периферическая кровь |
| Количество образцов | 288 |
| Время подготовки библиотек | от 8 часов (без учета пробоподготовки и проведения секвенирования) |
| Набор для выделения ДНК | ПРОБА-МЧ-Макс (ДНК-Технология). Возможность использования других наборов для выделения ДНК уточняйте у производителя |
| Срок годности набора для подготовки библиотек | 12 месяцев |
| Условия хранения |
● плюсовая часть +2...+8° С ● минусовая часть -18…-22° С |
| Программное обеспечение | ПО HLA-Эксперт (устанавливается на десктопный компьютер) |
| Автоматизация | Фасовка А — автоматизированная раскапка амплификационных смесей |
| Специфическое оборудование: |
• секвенатор MiSeq, Illumina • амплификатор детектирующий: ДТпрайм (ДНК-Технология), CFX96 (Bio-Rad, США) или QuantStudio5 (Applied Biosystems, США) - в чистой зоне для контроля качества выделенной ДНК • флуориметр • амплификатор* ДТпрайм, ДТлайт, ДТклассик (ДНК-Технология, Россия), Verity (Applied Biosystems, США), CFX96 (Bio-Rad, США) - в зоне подготовки библиотек. *Возможность использования других амплификаторов уточняйте у производителя |
|
Валидированные секвенаторы* |
Комплект реагентов для секвенирования |
Количество образцов в запуске |
Подходащая комплектация HLA-Эксперт |
Каталожный номер |
|
Miseq (Illumina) |
Не включен |
288 |
v3-600 |
- фасовка N - фасовка A |
|
MiSeq Reagent Kit v3-600 cycles |
288 |
v3-600 |
- фасовка N - фасовка A |
|
|
MiSeq Reagent Kit v2-500 cycles |
192 |
v2-500 |
- фасовка N - фасовка A |
