X
Меню

8 800 200-75-15
+7 495 640-17-71
mail@dna-technology.ru

Поиск

FAQ

Какие наборы реагентов для выделения ДНК подходят?

Набор для выделения ДНК и проведения полногеномной амплификации (Комплект реагентов для амплификации MDA) является частью комплекта поставки набора. Под другие наборы для выделения – нет валидации.

Можно ли обойтись без Phix Control?

Не рекомендуется, т.к. данные секвенирования Phix Control позволяют оценить успешность запуска и яляются важным инструментом для диагностики проблем (помогают выявить причины неудачных запусков).

Какой биоматериал используется?

Клетки трофэктодермы, полученные на 5 сутки развития эмбриона. Бластомеры не используются в анализе по ряду причин (высокий риск гибели эмбриона после биопсии; риск получения ложноположительных/ ложноотрицательных результатов)

Входит ли набор химии для секвенирования в комплект поставки набора?

Существует 3 комплекта поставки наборов:
S5-517-AX Комплектация A.N.384 – комплект реагентов для секвенирования отсутствует;
S6-517-BX Комплектация В.N.384 – NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles). Кат. № 20024906. 1 набор входит в эту комплектацию;
S6-517-B9 Комплектация В.N.96х4 – NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles). Кат. № 20024904. 4 набора входят в эту комплектацию.
Отдельно необходимо приобрести (закупает клиент) Phix Control и NaOH (1М или 10М)

Какой набор химии для секвенирования используется?

NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles). Кат. № 20024906 (для секвенирования 384 образцов), либо NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles). Кат. № 20024904 (для секвенирования 96 образцов)

Можно ли использовать другие модели секвенатора?

На данный момент другие секвенаторы не валидированы. По согласованию с производителем возможно использование NextSeq 1000 and NextSeq 2000 при условии внутрилабораторной валидации.

Какая модель секвенатора подходит для работы с набором?

NextSeq 500/550Dx, Illumina (IVD) или NextSeq 500/550, Illumina (RUO)

На какое количество образцов рассчитан набор?

Набор для приготовления библиотек рассчитан на 384 образца. В зависимости от варианта набора химии для секвенирования можно ставить либо 384 образца в один запуск секвенатора, либо ставить 4 запуска по 96 образцов (в зависимости от потока в лаборатории и сроков выдачи результатов).

Какое специфическое оборудование нужно для работы с набором АнеуСкрин?

Для разворачивания программного обеспечения и обработки данных - вычислительный кластер или облачное решение. Вычислительный кластер можно приобрести у компании «ДНК-Технология» (комплект ДТсинергия) или использовать имеющееся у клиента оборудование, если оно соответствует необходимым техническим требованиям. Облачное решение предоставляется через IT-специалистов «ДНК-Технологии».

Секвенатор NextSeq 500/550 или NextSeqTM 550Dx (Illumina, США)

Термошейкер с адаптером для пробирок 2,0 мл

Электрический лабораторный аспиратор с колбой-ловушкой для удаления надосадочных жидкостей

Магнитные штативы для пробирок 2,0 мл.

Магнитный штатив для стрипов 0,2 мл либо для пробирок 1,5 мл

Амплификатор с горячей крышкой

Шейкер для планшетов/стрипов

Флуориметр (например, Qubit)

Для дополнительного контроля качества - оборудование для проведения электрофореза

Какие факторы могут повлиять на результат исследования АнеуСкрин?

1.    Наличие у матери опухолевого заболевания, в т.ч. доброкачественного (например, миома матки);
2.    Тяжелые аутоиммунные процессы в организме матери;
3.    ОРВИ и другие воспалительные процессы;
4.    Недавние хирургические вмешательства у матери;
5.     Дефицит витамина B12, HBB-гемаглобинопатии, ранее установленная гипертония, приём некоторых лекарственных препаратов (гепарин);
6.    Особенности кариотипа матери (например, наличие кариотипа 47, XXX), мозаицизм в соматических клетках у плода, в плаценте или у матери (например, мозаичный вариант кариотипа 45, X0);
7.    Индекс массы тела беременной женщины более 30 кг/м2;
8.    Синдром исчезающего близнеца.

Есть ли ограничения к проведению исследования АнеуСкрин?

Исследование не проводится при сроке беременности менее 10 недель;

после переливания аллогенной крови менее 2 недель назад;

после хирургических вмешательств менее 4 недель назад;

Если женщине когда-либо делалась трансплантация органов или костного мозга, либо проводилась терапия аллогенными клетками.

Исследование не предназначено для скрининга носительства каких-либо генетических заболеваний у беременной женщины, а также для выявления у плода риска сбалансированных структурных аномалий хромосом, хромосомных микроделеций/микродупликаций, полиплоидии, моногенных и других генетических заболеваний, не связанных с анеуплоидиями.

С какого срока беременности можно проводить исследование?

С 10 акушерских недель (с момента последней менструации). До 10 недель количество ДНК плода в крови матери недостаточно для получения достоверных результатов НИПС.

Является ли многоплодная беременность противопоказанием к проведению исследования?

Многоплодная беременность двумя плодами не является противопоказанием для исследования АнеуСкрин. Однако риск анеуплоидий будет определен только для 13, 18 и 21 хромосом, а оценка риска анеуплоидий по половым хромосомам не производится.
При беременности 3 и более плодами исследование возможно только в научно-исследовательском режиме (RUO).

Можно ли использовать другие пробирки для крови?

Использовать невалидированные пробирки для крови настоятельно не рекомендуется, так как это может значительно повлиять на качество получаемых результатов.

Какие пробирки для забора крови можно использовать совместно с набором?

Вакуумные пробирки для взятия крови типа VACUETTE с ЭДТА в конечной концентрации 2,0 мг/мл, либо пробирки со стабилизатором внеклеточной ДНК Streck Cell-Free DNA BCT.

Обратите внимание, что условия хранения и транспортировки различаются для этих типов пробирок. Для пробирок с ЭДТА транспортировка и хранение крови до получения плазмы производятся при температуре 2-8 °С не более 3 часов. Пробирки со стабилизатором вкДНК позволяют хранить и транспортировать кровь дольше и при более высокой температуре (транспортировка согласно инструкции производителя)

Страницы