Набор для выделения ДНК и проведения полногеномной амплификации (Комплект реагентов для амплификации MDA) является частью комплекта поставки набора. Под другие наборы для выделения – нет валидации.
Не рекомендуется, т.к. данные секвенирования Phix Control позволяют оценить успешность запуска и яляются важным инструментом для диагностики проблем (помогают выявить причины неудачных запусков).
Клетки трофэктодермы, полученные на 5 сутки развития эмбриона. Бластомеры не используются в анализе по ряду причин (высокий риск гибели эмбриона после биопсии; риск получения ложноположительных/ ложноотрицательных результатов)
Существует 3 комплекта поставки наборов:
S5-517-AX Комплектация A.N.384 – комплект реагентов для секвенирования отсутствует;
S6-517-BX Комплектация В.N.384 – NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles). Кат. № 20024906. 1 набор входит в эту комплектацию;
S6-517-B9 Комплектация В.N.96х4 – NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles). Кат. № 20024904. 4 набора входят в эту комплектацию.
Отдельно необходимо приобрести (закупает клиент) Phix Control и NaOH (1М или 10М)
NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles). Кат. № 20024906 (для секвенирования 384 образцов), либо NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles). Кат. № 20024904 (для секвенирования 96 образцов)
На данный момент другие секвенаторы не валидированы. По согласованию с производителем возможно использование NextSeq 1000 and NextSeq 2000 при условии внутрилабораторной валидации.
NextSeq 500/550Dx, Illumina (IVD) или NextSeq 500/550, Illumina (RUO)
Набор для приготовления библиотек рассчитан на 384 образца. В зависимости от варианта набора химии для секвенирования можно ставить либо 384 образца в один запуск секвенатора, либо ставить 4 запуска по 96 образцов (в зависимости от потока в лаборатории и сроков выдачи результатов).
Для разворачивания программного обеспечения и обработки данных - вычислительный кластер или облачное решение. Вычислительный кластер можно приобрести у компании «ДНК-Технология» (комплект ДТсинергия) или использовать имеющееся у клиента оборудование, если оно соответствует необходимым техническим требованиям. Облачное решение предоставляется через IT-специалистов «ДНК-Технологии».
Секвенатор NextSeq 500/550 или NextSeqTM 550Dx (Illumina, США)
Термошейкер с адаптером для пробирок 2,0 мл
Электрический лабораторный аспиратор с колбой-ловушкой для удаления надосадочных жидкостей
Магнитные штативы для пробирок 2,0 мл.
Магнитный штатив для стрипов 0,2 мл либо для пробирок 1,5 мл
Амплификатор с горячей крышкой
Шейкер для планшетов/стрипов
Флуориметр (например, Qubit)
Для дополнительного контроля качества - оборудование для проведения электрофореза
1. Наличие у матери опухолевого заболевания, в т.ч. доброкачественного (например, миома матки);
2. Тяжелые аутоиммунные процессы в организме матери;
3. ОРВИ и другие воспалительные процессы;
4. Недавние хирургические вмешательства у матери;
5. Дефицит витамина B12, HBB-гемаглобинопатии, ранее установленная гипертония, приём некоторых лекарственных препаратов (гепарин);
6. Особенности кариотипа матери (например, наличие кариотипа 47, XXX), мозаицизм в соматических клетках у плода, в плаценте или у матери (например, мозаичный вариант кариотипа 45, X0);
7. Индекс массы тела беременной женщины более 30 кг/м2;
8. Синдром исчезающего близнеца.
Исследование не проводится при сроке беременности менее 10 недель;
после переливания аллогенной крови менее 2 недель назад;
после хирургических вмешательств менее 4 недель назад;
Если женщине когда-либо делалась трансплантация органов или костного мозга, либо проводилась терапия аллогенными клетками.
Исследование не предназначено для скрининга носительства каких-либо генетических заболеваний у беременной женщины, а также для выявления у плода риска сбалансированных структурных аномалий хромосом, хромосомных микроделеций/микродупликаций, полиплоидии, моногенных и других генетических заболеваний, не связанных с анеуплоидиями.
С 10 акушерских недель (с момента последней менструации). До 10 недель количество ДНК плода в крови матери недостаточно для получения достоверных результатов НИПС.
Многоплодная беременность двумя плодами не является противопоказанием для исследования АнеуСкрин. Однако риск анеуплоидий будет определен только для 13, 18 и 21 хромосом, а оценка риска анеуплоидий по половым хромосомам не производится.
При беременности 3 и более плодами исследование возможно только в научно-исследовательском режиме (RUO).
Использовать невалидированные пробирки для крови настоятельно не рекомендуется, так как это может значительно повлиять на качество получаемых результатов.
Вакуумные пробирки для взятия крови типа VACUETTE с ЭДТА в конечной концентрации 2,0 мг/мл, либо пробирки со стабилизатором внеклеточной ДНК Streck Cell-Free DNA BCT.
Обратите внимание, что условия хранения и транспортировки различаются для этих типов пробирок. Для пробирок с ЭДТА транспортировка и хранение крови до получения плазмы производятся при температуре 2-8 °С не более 3 часов. Пробирки со стабилизатором вкДНК позволяют хранить и транспортировать кровь дольше и при более высокой температуре (транспортировка согласно инструкции производителя)