В каком формате сохраняются данные, полученные в ПО «ДНК-Технология»
*.pdf Acrobat Reader
*.jpg JPEG
*.html HTML
*.оdt Open Office
*.pdf Acrobat Reader
*.jpg JPEG
*.html HTML
*.оdt Open Office
Исходные данные (математически не обработанные данные, без вычета базовой линии и фитирования) позволяют визуально оценить рост сигнала флуоресценции по каждому каналу детекции.
Используется для проверки сомнительных результатов (низкий уровень флуоресценции, неправильная форма кривой и т.д.)
По умолчанию, при анализе оптических измерений программа RealTime_PCR использует Геометрический метод (Cp) - основан на математическом анализе формы кривой накопления ДНК в ходе ПЦР.
Пороговый метод (Ct) - используют в случае нестандартных ситуаций, когда кривая амплификации существенно отличается от классической кривой накопления ДНК в ходе ПЦР. Порговый метод может быть рекомендован другими производителями тест-систем.
Основан на проведении «пороговой» линии параллельно оси абсцисс и определении номера цикла реакции (порогового цикла), на котором кривая амплификации для данной пробирки пересекает пороговую линию.
Каждый вариант искомого генетического полиморфизма определяется одновременно по двум каналам: Fam и Hex. По каналу Cy5 определяется внутренний контроль (ВК) – количество геномной ДНК человека
В графе «Полиморфизм»:
Возможно определение одного из трех вариантов генотипа:
- гетерозигота «Вариант_1 аллеля / Вариант_2 аллеля»
- гомозигота по аллелю «Вариант_1 аллеля»
- гомозигота по аллелю «Вариант_2 аллеля»
Внимание!!!Получение нормального или мутантного аллеля не зависит от цветовой кодировки канала. ПО автоматически интерпретирует результат.
- в одном или обоих столбцах – отклонения по теппературным пикам (см. инструкцию, низкий или высокий пик кривой плавления, перепутаны смеси амплификации, неправильное расположение пробирок или стрипов в термоблоке).
В графе «ВК» - указывается:
- недостоверный результат – по каналу Cy5 значение Ср ВК >32,0 – менее 1,0 нг геномной ДНК)
См. инструкции к наборам реагентов (на сайте www.dna-technology.ru, раздел Инструкции. Оборудование. Реагенты)
и по телефону Службы клиентской поддержки +7 (800) 200-75-15
«+» – в образце присутствуют фрагменты искомой ДНК (зарегистрирован экспоненциальный рост сигнала для Специфики и зарегистрирован/НЕ зарегистрирован рост сигнала для ВК).
Специфика в стандартных программах (кроме генотипирования - Анализ полиморфизмов, плавление) для наборов «ДНК-Технология» - определяется по каналу Fam.
Внутренний контроль (ВК) в стандартных программах (кроме генотипирования - Анализ полиморфизмов, плавление) для наборов «ДНК-Технология» - определяется по каналу Hex.
Таким образом, положительный результат - это:
Fam + /Hex+ , или Fam + /Hex-
«-» – в образце отсутствуют фрагменты искомой ДНК (отсутствует экспоненциальный рост сигнала для Специфики, в случае использования внутреннего контрольного образца (ВК) – зарегистрирован экспоненциальный рост сигнала для ВК).
Таким образом, отрицательный результат - это: Fam - /Hex+
«нд» – недостоверный результат (при использовании ВК - отсутствует экспоненциальный рост сигнала, как для Специфики, так и для ВК).
Таким образом, недостоверный результат - это: Fam - /Hex-
См. инструкцию к прибору (на сайте www.dna-technology.ru, раздел Инструкции. Оборудование. ДТпрайм); инструкции к наборам и по телефону Службы клиентской поддержки
+7 (800) 200-75-15
Интеграция данных возможна, для этого нужно связаться с IT-специалистами «ДНК-Технология»:
Тел. 8 (800) 200-75-15
e-mail: <hotline@dna-technology.ru>
Специализированный отчет для:
- Биоценозы (набор реагентов для анализа биоценоза урогенитального тракта у женщин Фемофлор, Андрофлор у мужчин)
- SNP, анализ полиморфизмов плавление
- HPV (количественный анализ и типирование вирусов папилломы человека – для набора реагентов Квант)
- мультиплексный анализ
- типирование HLA
- анализ локусов AZF
- онкогенетика BRCA, CHECK2
- RHD, Gender
-Иммуноквантекс
Качественный анализ - позволяет определить наличие или отсутствие в образце искомого фрагмента ДНК
Количественный со стандартами
Анализ полиморфизмов, плавление (для генотипирования человека)
Мультиплексный анализ (TNC-комплекс, ГерпесКомплекс, UMC-комплекс)
Биоценоз (количественный анализ состояния биоценоза урогенитального тракта у женщин Фемофлор, Андрофлор у мужчин)
НРV (для обнаружения, типирования и количественного анализа вирусов папилломы человека: наборы реагентов Квант)
ГМИ (для обнаружения геномодифицированных источников,
определения их количества (согласно стандартам, действующим на территории РФ: 0,1%, 1%, 5%)
HLA DR, HLA DQ (для анализа HLA)
AZF (анализ факторов мужского бесплодия – фактора азооспермии)
RHD, Gender (Пренатальная диагностика)
Относительный - позволяет оценить количество искомого фрагмента ДНК в исследуемых образцах относительно «базовой» пробирки
Анализ полиморфизмов, 2 краски - анализ генетических полиморфизмов, например, SNP, с использованием двух различных флуорофоров в одной пробирке
Программное обеспечение и ini-файлы можно получить/обновить:
на CD-диске, вложенном в инструкции к приборам при поставке оборудования
на сайте www.dna-technology, раздел Сервис и гарантия. Программное обеспечение для оборудования (ПО для оборудования) и Файлы с параметрами тестов для подключения к программе (ini-файлы)