X
Меню

8 800 200-75-15
+7 495 640-17-71
mail@dna-technology.ru

Поиск

Набор реагентов АнеуПГТ

назад

Что делать при получении неоднозначных результатов (деградация, отсутствие WGA продукта, одинаковый профиль у нескольких эмбрионов)?

При наличии проблем с результатами рекомендуется обратиться в службу клиентской поддержки ДНК-Технологии.

Если продукт WGA отсутствует или по результатам секвенирования виден профиль со значительной деградацией ДНК, то лаборатория должна рекомендовать клинике сделать ребиопсию (возможность проведения ребиопсии обсуждается уже с лечащим врачом/эмбриологом).

При получение одинаковых или очень похожих профилей эмбрионов (только в случае аномальных эмбрионов), полученных от одной пациентки, может возникнуть подозрение на неправильную биопсию (н-р, эмбриолог пробиопсировал один и тот же эмбрион дважды). В этом случае лаборатория должна уведомить клинику о получение подозрительных данных.

Решение данной проблемы может быть следующим: постановка теста на отцовство эмбрионам с одинаковым профилем; в случае, если это биопсия одного и тоже эмбриона, о может быть рекомендована повторная биопсия.

Какие факторы могут повлиять на результат исследования?

Чистота буфера для образцов

Контаминация

Входная концентрация ДНК

Условия хранения и транспортировки. Нарушение этих условий может привести к деградации материала, из-за чего полученные результаты будут неинформативными, ошибочными.
Неправильная пробоподготовка. Нарушение процессов пробоподготвоки может привести к получению неинформативных, ошибочных результатов.

Клиники ЭКО сами готовят буфер для хранения и транспортировки клеток трофэктодермы?

В зависимости от договоронностей с клиникой – клиника может это делать самостоятельно, а может запрашивать буфер или уже раскапанные пробирки с буфером у лаборатории.

Используются ли какие-либо контроли при постановке WGA?

При постановке WGA, вместе с клиническими образцами, ставятся отрицательные контроли K-, которые представляют собой пробы (1-2 микролитра) среды из последней (обычно третьей) промывочной капли в ряду промывочных капель. Количество отрицательных контролей, необходимых для постановки, зависит от количества клиник ЭКО, предоставивших образцы. От каждой клинки необходимо взять не менее одной пробирки К-. Также для проверки чистоты реагентов используется контроль «mQ» (в чистую пробирку 0.2 мл добавляется объем mQ равный объему специализированного буфера, в котором хранятся клетки трофэктодермы).

Проводится ли контроль чистоты буфера для хранения клеток трофэктодермы перед анализом клинических образцов?

Перед использованием буфера его обязаны проверить на чистоту. Оценку чистоты проводят либо клиники ЭКО, либо лаборатория, в зависимости от того, какая сторона предоставляет буфер.

Клиники ЭКО сами готовят буфер для хранения и транспортировки клеток трофэктодермы?

В зависимости от договоронностей с клиникой – клиника может это делать самостоятельно, а может запрашивать буфер или уже раскапанные пробирки с буфером у лаборатории.

В каком формате выдается результат исследования?

После обработки данных программное обеспечение предоставляет рассчитанные значения контролей качества, информацию о генотипе, а также график распределения бинов, картированный на референсный геном. Интерпретация полученных результатов проводится сотрудниками лаборатории/ врачами/ эмбриологами.

Обязательно ли на стадии WGA использовать холодовый 96-луночный штатив для микропробирок 0,2 мл?

Да, обязательно.

Какой группе пациентов рекомендуется данный анализ?

Всем женщинам в программе ЭКО (в качестве скринингового исследования)

Аномальный кариотип у родителей

Выявленные сбалансированные транслокации у родителей

Старший (поздний) репродуктивный возраст (> 35 лет)

Многократные неудачные попытки ЭКО

Привычное невынашивание беременности

Нарушение процессов сперматогенеза (мужской фактор)

Есть ли ограничения у метода?

Явным ограничением является только входная концентрация образца (не менее 0,006 нг/мкл ДНК, что соответствует количеству ДНК в одной клетке).

Какие виды хромосомных аномалий плода детектирует исследование АнеуПГТ?

Полные и мозаичные формы анеуплоидий, сегментарные делеции и дупликации в полной и мозаичной форме.

Какое специфическое оборудование нужно для работы с набором АнеуПГТ?

Для разворачивания программного обеспечения и обработки данных - вычислительный кластер или облачное решение. Вычислительный кластер можно приобрести у компании «ДНК-Технология» (комплект ДТсинергия) или использовать имеющееся у клиента оборудование, если оно соответствует необходимым техническим требованиям. Облачное решение предоставляется через IT-специалистов «ДНК-Технологии».

Секвенатор NextSeq 500/550 или NextSeqTM 550Dx (Illumina, США)
Холодовой штатив для 0.2 мл пробирок
Комплект оборудования для электрофореза нуклеиновых кислот в агарозных и акриламидных гелях
Магнитный штатив для 96-луночных плашек
Амплификатор с горячей крышкой
Флуориметр (например, Qubit)
Система автоматизированного электрофореза (например, TapeStation4200)
Высокоскоростной шейкер для планшетов
Центрифуга с ротором для планшетов

Входит ли набор реагентов для выделения ДНК в комплект поставки набора?

Да, входит.

Какие наборы реагентов для выделения ДНК подходят?

Набор для выделения ДНК и проведения полногеномной амплификации (Комплект реагентов для амплификации MDA) является частью комплекта поставки набора. Под другие наборы для выделения – нет валидации.

Можно ли обойтись без Phix Control?

Не рекомендуется, т.к. данные секвенирования Phix Control позволяют оценить успешность запуска и яляются важным инструментом для диагностики проблем (помогают выявить причины неудачных запусков).

Страницы