Меню

8 800 200-75-15
+7 495 640-17-71

Поиск

Программное обеспечение

В каком формате сохраняются данные, полученные в ПО «ДНК-Технология»

*.pdf Acrobat Reader

*.jpg JPEG

*.html HTML

*.оdt Open Office

Что такое и в каких случаях используют анализ по исходным данным

  • Исходные данные (математически не обработанные данные, без вычета базовой линии и фитирования) позволяют визуально оценить рост сигнала флуоресценции по каждому каналу детекции.

  • Используется для проверки сомнительных результатов (низкий уровень флуоресценции, неправильная форма кривой и т.д.)

В каких случаях проводят анализ результатов с использованием порогового метода (Сt), а в каких – геометрического метода (Cp)

  • По умолчанию, при анализе оптических измерений программа RealTime_PCR использует Геометрический метод (Cp) - основан на математическом анализе формы кривой накопления ДНК в ходе ПЦР.

  • Пороговый метод (Ct) - используют в случае нестандартных ситуаций, когда кривая амплификации существенно отличается от классической кривой накопления ДНК в ходе ПЦР. Порговый метод может быть рекомендован другими производителями тест-систем.

Основан на проведении «пороговой» линии параллельно оси абсцисс и определении номера цикла реакции (порогового цикла), на котором кривая амплификации для данной пробирки пересекает пороговую линию.

Критерии результатов (положительного/отрицательного/недостоверного) при проведении анализа полиморфизмов

  • Каждый вариант искомого генетического полиморфизма определяется одновременно по двум каналам: Fam и Hex. По каналу Cy5 определяется внутренний контроль (ВК) – количество геномной ДНК человека

 

  • В графе «Полиморфизм»:

Возможно определение одного из трех вариантов генотипа:

- гетерозигота «Вариант_1 аллеля / Вариант_2 аллеля»

- гомозигота по аллелю «Вариант_1 аллеля»

- гомозигота по аллелю «Вариант_2 аллеля»

Внимание!!!Получение нормального или мутантного аллеля не зависит от цветовой кодировки канала. ПО автоматически интерпретирует результат.

 

- в одном или обоих столбцах – отклонения по теппературным пикам (см. инструкцию, низкий или высокий пик кривой плавления, перепутаны смеси амплификации, неправильное расположение пробирок или стрипов в термоблоке).

 

  • В графе «ВК» - указывается:

- недостоверный результат – по каналу Cy5 значение Ср ВК >32,0 – менее 1,0 нг геномной ДНК)

 

См. инструкции к наборам реагентов (на сайте www.dna-technology.ru, раздел Инструкции. Оборудование. Реагенты)

и по телефону Службы клиентской поддержки +7 (800) 200-75-15

Критерии результатов (положительного/отрицательного/недостоверного)

  • «+»в образце присутствуют фрагменты искомой ДНК (зарегистрирован экспоненциальный рост сигнала для Специфики и зарегистрирован/НЕ зарегистрирован рост сигнала для ВК).

Специфика в стандартных программах (кроме генотипирования - Анализ полиморфизмов, плавление) для наборов «ДНК-Технология» - определяется по каналу Fam.

Внутренний контроль (ВК) в стандартных программах (кроме генотипирования - Анализ полиморфизмов, плавление) для наборов «ДНК-Технология» - определяется по каналу Hex.

Таким образом, положительный результат - это:

Fam + /Hex+ , или Fam + /Hex-

  • «-»в образце отсутствуют фрагменты искомой ДНК (отсутствует экспоненциальный рост сигнала для Специфики, в случае использования внутреннего контрольного образца (ВК) – зарегистрирован экспоненциальный рост сигнала для ВК).

Таким образом, отрицательный результат - это: Fam - /Hex+

  • «нд»недостоверный результат (при использовании ВК - отсутствует экспоненциальный рост сигнала, как для Специфики, так и для ВК).

Таким образом, недостоверный результат - это: Fam - /Hex-

См. инструкцию к прибору (на сайте www.dna-technology.ru, раздел Инструкции. Оборудование. ДТпрайм); инструкции к наборам и по телефону Службы клиентской поддержки

+7 (800) 200-75-15

 

Можно ли интегрировать данные, полученные в ПО «ДНК-Технология», в ЛИС

Интеграция данных возможна, для этого нужно связаться с IT-специалистами «ДНК-Технология»:

Тел. 8 (800) 200-75-15

e-mail: <hotline@dna-technology.ru>

Для каких тестов разработан специализированный отчет

Специализированный отчет для:

- Биоценозы (набор реагентов для анализа биоценоза урогенитального тракта у женщин Фемофлор, Андрофлор у мужчин)

- SNP, анализ полиморфизмов плавление

- HPV (количественный анализ и типирование вирусов папилломы человека – для набора реагентов Квант)

- мультиплексный анализ

- типирование HLA

- анализ локусов AZF

- онкогенетика BRCA, CHECK2

- RHD, Gender

-Иммуноквантекс

Какие типы анализа можно реализовать с помощью ПО «ДНК-Технология»

  • Качественный анализ - позволяет определить наличие или отсутствие в образце искомого фрагмента ДНК

  • Количественный со стандартами

  • Анализ полиморфизмов, плавление (для генотипирования человека)

  • Мультиплексный анализ (TNC-комплекс, ГерпесКомплекс, UMC-комплекс)

  • Биоценоз (количественный анализ состояния биоценоза урогенитального тракта у женщин Фемофлор, Андрофлор у мужчин)

  • НРV (для обнаружения, типирования и количественного анализа вирусов папилломы человека: наборы реагентов Квант)

  • ГМИ (для обнаружения геномодифицированных источников,

определения их количества (согласно стандартам, действующим на территории РФ: 0,1%, 1%, 5%)

  • HLA DR, HLA DQ (для анализа HLA)

  • AZF (анализ факторов мужского бесплодия – фактора азооспермии)

  • RHD, Gender (Пренатальная диагностика)

  • Относительный - позволяет оценить количество искомого фрагмента ДНК в исследуемых образцах относительно «базовой» пробирки

  • Анализ полиморфизмов, 2 краски - анализ генетических полиморфизмов, например, SNP, с использованием двух различных флуорофоров в одной пробирке

Как можно получить/обновить программное обеспечение и ini-файлы

Программное обеспечение и ini-файлы можно получить/обновить:

  • на CD-диске, вложенном в инструкции к приборам при поставке оборудования

  • на сайте www.dna-technology, раздел Сервис и гарантия. Программное обеспечение для оборудования (ПО для оборудования) и Файлы с параметрами тестов для подключения к программе (ini-файлы)