Какие гены HLA типирует набор?
Гены A, B, C HLA I класса и гены DRB1, DQB1, DPB1 и DRB3/4/5 HLA II класса.
8 800 200-75-15
+7 495 640-17-71
mail@dna-technology.ru
РУС
ENG
X
Меню
Гены A, B, C HLA I класса и гены DRB1, DQB1, DPB1 и DRB3/4/5 HLA II класса.
На 288 образцов. 288 исследований означает типирование 288 образцов по 9 генам (A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1 и DRB3/4/5).
При наличии проблем с результатами рекомендуется обратиться в службу клиентской поддержки ДНК-Технологии.
Если продукт WGA отсутствует или по результатам секвенирования виден профиль со значительной деградацией ДНК, то лаборатория должна рекомендовать клинике сделать ребиопсию (возможность проведения ребиопсии обсуждается уже с лечащим врачом/эмбриологом).
При получение одинаковых или очень похожих профилей эмбрионов (только в случае аномальных эмбрионов), полученных от одной пациентки, может возникнуть подозрение на неправильную биопсию (н-р, эмбриолог пробиопсировал один и тот же эмбрион дважды). В этом случае лаборатория должна уведомить клинику о получение подозрительных данных.
Решение данной проблемы может быть следующим: постановка теста на отцовство эмбрионам с одинаковым профилем; в случае, если это биопсия одного и тоже эмбриона, о может быть рекомендована повторная биопсия.
Чистота буфера для образцов
Контаминация
Входная концентрация ДНК
Условия хранения и транспортировки. Нарушение этих условий может привести к деградации материала, из-за чего полученные результаты будут неинформативными, ошибочными.
Неправильная пробоподготовка. Нарушение процессов пробоподготвоки может привести к получению неинформативных, ошибочных результатов.
В зависимости от договоронностей с клиникой – клиника может это делать самостоятельно, а может запрашивать буфер или уже раскапанные пробирки с буфером у лаборатории.
При постановке WGA, вместе с клиническими образцами, ставятся отрицательные контроли K-, которые представляют собой пробы (1-2 микролитра) среды из последней (обычно третьей) промывочной капли в ряду промывочных капель. Количество отрицательных контролей, необходимых для постановки, зависит от количества клиник ЭКО, предоставивших образцы. От каждой клинки необходимо взять не менее одной пробирки К-. Также для проверки чистоты реагентов используется контроль «mQ» (в чистую пробирку 0.2 мл добавляется объем mQ равный объему специализированного буфера, в котором хранятся клетки трофэктодермы).
Перед использованием буфера его обязаны проверить на чистоту. Оценку чистоты проводят либо клиники ЭКО, либо лаборатория, в зависимости от того, какая сторона предоставляет буфер.
В зависимости от договоронностей с клиникой – клиника может это делать самостоятельно, а может запрашивать буфер или уже раскапанные пробирки с буфером у лаборатории.
После обработки данных программное обеспечение предоставляет рассчитанные значения контролей качества, информацию о генотипе, а также график распределения бинов, картированный на референсный геном. Интерпретация полученных результатов проводится сотрудниками лаборатории/ врачами/ эмбриологами.
Да, обязательно.
Всем женщинам в программе ЭКО (в качестве скринингового исследования)
Аномальный кариотип у родителей
Выявленные сбалансированные транслокации у родителей
Старший (поздний) репродуктивный возраст (> 35 лет)
Многократные неудачные попытки ЭКО
Привычное невынашивание беременности
Нарушение процессов сперматогенеза (мужской фактор)
Явным ограничением является только входная концентрация образца (не менее 0,006 нг/мкл ДНК, что соответствует количеству ДНК в одной клетке).
Полные и мозаичные формы анеуплоидий, сегментарные делеции и дупликации в полной и мозаичной форме.
Для разворачивания программного обеспечения и обработки данных - вычислительный кластер или облачное решение. Вычислительный кластер можно приобрести у компании «ДНК-Технология» (комплект ДТсинергия) или использовать имеющееся у клиента оборудование, если оно соответствует необходимым техническим требованиям. Облачное решение предоставляется через IT-специалистов «ДНК-Технологии».
Секвенатор NextSeq 500/550 или NextSeqTM 550Dx (Illumina, США)
Холодовой штатив для 0.2 мл пробирок
Комплект оборудования для электрофореза нуклеиновых кислот в агарозных и акриламидных гелях
Магнитный штатив для 96-луночных плашек
Амплификатор с горячей крышкой
Флуориметр (например, Qubit)
Система автоматизированного электрофореза (например, TapeStation4200)
Высокоскоростной шейкер для планшетов
Центрифуга с ротором для планшетов
Да, входит.